Hoy día Illumina es quizá la plataforma líder de NGS (Next Generation Sequencing).

Ventajas:

  • Proporciona una gran cantidad de datos

  • Bajo coste

  • Baja tasa de error

Desventajas:

  • Reads cortas

  • No proporciona una cobertura uniforme

  • Los errores no se distribuyen aleatoriamente

    Los errores no se distribuyen aleatoriamente a lo largo de la secuencia sino que se repiten en las mismas regiones incluso en experimentos de secuenciación independientes.

APLICACIONES de la secuenciación con illumina

Hemos realizado muchos tipos de proyectos de secuenciación utilizando secuencia illumina para sectores muy variados: hospitales, grupos de investigación, empresas biotecnológicas e industria agroalimentaria y de producción de biocombustibles. 

Los más importantes  tipos de proyecto  han sido:

  • Metagenómica (Shot-Gun y 16S)

  • Genómica

    Especialmente para secuenciar genomas de bacterias virus y hongos. 

  • RNA-seq

    Tanto para analizar transcriptomas de organismos modelo como de organismos no modelo para los que no se disponía de genoma de referencia en las bases de datos.

  • Amplicones de genes específicos

SECUENCIADORES ILLUMINA

Illumina cuenta con varias opciones de secuenciadores: