Servicio BG7 completo, una solución integral para genomas de bacteria

Este servicio incluye secuenciación, ensamblaje de novo y anotación funcional completa.

Archivo: Assembly_and_BG7_Annotation_service_description_2016.pdf 

 

El servicio BG7 completo es un servicio que le proporciona una solución integral a su proyecto de genómica bacteriana. Este servicio resuelve todas las fases del proyecto:

Diseño experimental: Incluye la elección de las tecnologías, el diseño experimental y el análisis de coste y tiempo de ejecución que mejor se adapten a los objetivos del proyecto.

Secuenciación: con la tecnología más apropiada para el proyecto: PacBio, Illumina, Ion Torrent o 454.

Ensamblaje de novo: con los métodos más avanzados de ensamblaje para cada tecnología.

Anotación con BG7: BG7 es un método propio, específicamente diseñado para la anotación de genomas bacterianos obtenidos por NGS. Este método ha sido publicado en PLOS ONE.

Anotación específica de genes de interés: facilitando los datos funcionales importantes mediante anotación manual de los mismos.

 

Sistema de anotación BG7, específicamente diseñado para NGS

BG7 es un sistema completo de anotación de genomas de bacteria que incluye una exhaustiva predicción de genes integrada con una anotación rica en datos funcionales . Está especialmente diseñado para datos NGS. Todos los genes similares cualquier gen conocido de cualquier organismo pueden ser detectados. El sistema proporciona una completa anotación del genoma, incluso en el caso de que éste se encuentre fragmentado en miles de contigs.

Características del sistema de anotación BG7:

  • Tolera errores específicos de NGS
  • Predice ORFs basándose en la detección de similitudes con proteínas de Uniprot
  • Puede personalizarse según los objetivos y las funciones de interés específicos del proyecto: rutas metabólicas, biosíntesis de metabolitos secundarios, resistencia a antibióticos, proteínas de membrana,...
  • Escalable: como se realiza en la nube podemos hacer en paralelo la anotación de miles de genomas tardando el mismo tiempo que en la anotación de 1 genoma 

Nuestros resultados con BG7:

  • Un genoma anotado de forma rápida y completa, similar a los genomas anotados manualmente
  • Rico en anotaciones funcionales (GO, Interpro, EC, dominios funcionales, referencias a bases de datos)
  • Los resultados finales son compatibles con herramientas y navegadores abiertos: Artemis, Mauve, EBI tools, Expasy tools,...

Plazos de entrega para la anotación de genomas con BG7

  • Anotación de genomas en una semana

  • Genome Express: ¡anotación de genomas en un día!

BG7 ha sido reconocido por PacBio Biosciences como “PacBIO SMRT COMPATIBLE ANALYSIS PRODUCT”

Más información Genomas de bacteria con PacBio

Pregunta sobre este servicio por e-mail:

  •  info@era7.com

o rellenando el siguiente formulario:



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