RNA-Seq para bacteria: una perspectiva única de la función génica

RNA-seq está siendo cada vez más usado para explorar la expresión génica en bacterias, para conseguir información sobre el transcriptoma de un clon específico, de una comunidad bacteriana reducida o sobre el meta-transcriptoma de una comunidad bacteriana compleja. Un enfoque muy interesante es el de hacer  Dual RNA-seq para conocer más sobre las relaciones huésped-patógeno analizando la expresión de los genes del patógeno en relación con la expresión del huésped en diferentes condiciones.

RNA-Seq para bacterias

    -  No necesita un genoma de referencia

    -  Personalizado a los objetivos específicos del proyecto

    -  Anotación funcional rica (GO, Interpro, referencias)

    -  Cuantificación de la expresión génica

    -  Análisis de la expresión diferencial

Tiempo de Entrega

    -  Un transcriptoma en dos semanas

    -  Transcriptome Express: ¡un transcriptoma en una semana!

RNA-Seq es la nueva alternativa a los microarrays para analizar la expresión génica y obtener un perfil rápido y completo de tu transcriptoma. Una ventaja de RNA-Seq frente a los arrays de expresión es que en los experimentos de RNA-Seq pueden abordar cualquier transcriptoma desconocido y son capaces de detectar cualquier secuencia nueva sin tener ningún conocimiento previo sobre ella. Por el contrario los arrays necesitan diseñarse previamente y sólo son capaces de detectar secuencias conocidas previamente.

RNA-seq permite obtener información de aspectos específicos como:

    -  Análisis de los sitios de splicing para la expresión de isoformas

    -  RNAs reguladores

    -  Cuantificación de la expresión génica

    -  Análisis de la expresión diferencial entre distintas muestras

Trabajamos con las más avanzadas pipelines, basados en programas como Bowtie, Tophat, Cufflinks and Cuffdiff. Añadimos a los resultados una completa información funcional y ofrecemos análisis de GO (Gene Ontology) y otros estudios de enriquecimiento más complejos.

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