NEXTMICRO: Una plataforma bioinformática diseñada para manejar datos de brotes con NGS

NEXTMICRO: Una plataforma bioinformática diseñada para manejar datos de brotes con NGS

El proyecto fue financiado en parte por el CDTI (Centro para el Desarrollo Técnico Industrial) y fue desarrollado durante 2012 y 2013. 

El objetivo del proyecto fue el desarrollo de una plataforma capaz de manejar todos los datos de la secuenciación NGS y otros datos asociados de importancia en un brote.

El proyecto NEXTMICRO incluye el sistema de anotación BG7 (Vea la publicación sobre BG7 en PLOS ONE) y las nuevas pipelines de Cloud computing y servicios especialmente diseñados o adapatados a manejar los datos de NGS de brotes en hospitales y comunidades. 

Este proyecto ha mejorado nuestros servicios para hospitales e instituciones sanitarias y nos permitirá proporcionar:

  • Ayuda en el diseño de estrategias de secuenciación específicas
  • Servicios de Secuenciación
  • Ensamblaje y anotación funcional basada en BG7
  • Almacenamiento en Cloud y manejo de los datos
  • Informes adaptados al ambiente clínico
  • Ayuda en el diseño de métodos de diagnóstico molecular (MLST, PCR)
  • Seguimiento epidemiológico de los brotes y secuenciación de nuevos aislados relacionados si es necesario