Secuenciación NGS del Repertorio de células T

Ahora es posible el análisis del repertorio de TCR a través de la secuenciación NGS. Haciendo amplicones a partir de muestras sanguíneas pueden obtenerse decenas de miles de secuencias clonales. Esta información puede ser analizada de diferentes formas dependiendo del objetivo de los experimentos. 

  • Indice de Diversidad. Puede obtenerse una puntuación que representa el grado de diversidad clonal de la muestra.
  • Comparando puntos en el tiempo. Esto es muy útil cuando se analizan cambios en el repertorio de células T a lo largo de un proceso. Este proceso podría ser una infección, una enfermedad autoinmune, un análisis después de una vacunación, etc.  

La inmunología de tumores y la inmunoterapia podrían ser blancos de la secuenciación del repertorio de TCR. Los resultados que se obtienen secuenciando repertorios de TILs (Tumor Infiltrating Lymphocytes) pueden ser comparados con los resultados de la secuenciación de muestras sanguíneas.

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