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análisis de datos de arrays de Affymetrix

Ofrecemos servicios de consultoría a estos 3 niveles para los arrays de Affymetrix, tanto para aquellos orientados a genotipación, como a análisis de expresión o a análisis de sitios de unión a proteínas en el ADN (tecnología ChIP- on- chip).

 

Las tecnologías de arrays son tecnologías complejas de las que se puede obtener un elevado rendimiento si se conocen a fondo. Era7 Bioinformatics proporciona servicios bioinformáticos y de conocimiento experto para analizar los datos obtenidos con estas tecnologías. Ofrecemos servicios personalizados a 3 niveles:

 

  • Diseño experimental
  • Análisis bioinformático y estadístico
  • Interpretación de datos

 

Consultoría en el diseño de experimentos con arrays
Lo más importante para que unos datos de arrays sean útiles y contesten preguntas es el diseño experimental inicial. Las tecnologías de arrays no son fáciles de manejar y la forma en que deben plantearse los experimentos es diferente a cómo se plantean los experimentos clásicos. Por otro lado existen distintas tecnologías de arrays y hay que saber elegir la más adecuada. Era7 Bioinformatics puede asesorarte ayudándote en esta primera fase crucial en el resultado final.
Análisis bioinformático y estadístico
Análisis de datos de expresión Analizamos los datos de arrays y llevamos a cabo estudios de genómica funcional: estudios de enriquecimiento en términos de GO (Gene Ontology), de KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes), en sitios de unión de factores de transcripción o análisis de perfiles de expresión. Nuestro servicio de análisis de datos de microarrays es totalmente personalizado y se orientará a los objetivos del cliente. Además de realizar estudios de análisis funcional y de clusterización realizamos también estudios basados en la utilización de text mining en los que se obtienen datos de conocimiento basados en la asociación entre los identificadores de genes seleccionados y palabras clave relacionadas con el objeto de estudio.Este servicio está totalmente orientado a ayudar al médico o biólogo experimental a sacar partido a los datos obtenidos con los experimentos de arrays. También aportamos asesoría estadística.
Análisis de datos para genotipación Ofrecemos asesoría estadística y computación de alta eficiencia para desarrollar estudios de asociación a gran escala. Gracias a nuestra experiencia en el desarrollo de bases de datos y en el análisis de datos de microarrays ofrecemos un servicio de diseño y desarrollo de bases de datos específicas para datos de arrays, siguiendo los estándares y totalmente personalizadas.
Interpretación experta de datos
Muchos estudios de datos de arrays requieren un conocimiento realmente especializado para poder extraer datos con técnicas guiadas por hipótesis que no son totalmente sistemáticas. En este caso es necesario conocimiento experto para detectar un resultado interesante o para plantear una hipótesis con sentido biológico. Podemos ofrecer estudios de este tipo dentro de las áreas de inmunología y de genómica bacteriana (Ver publicaciones).