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análisis de VIH

Las tecnologías de secuenciación NGS permiten la cuantificación y caracterización de las distintas quasi-especies virales. Tecnologías como el sistema 454 de Roche es capaz de detectar variantes genéticas del virus del SIDA incluso si se encuentran en una proporción de incluso el 1% dentro de la población viral.

 

Era7 Bioinformatics aporta asesoramiento y consultoría para manejar este tipo de secuencias obtenidas mediante Next Generation Sequencing, diseñando y desarrollando estudios a medida con este tipo de secuencias de VIH. Con el sistema 454 de Roche la longitud de las reads es suficiente para poder detectar distintas combinaciones haplotípicas de puntos polimórficos en las proteínas diana. El análisis estadístico de los diferentes haplotipos presentes en las muestras de pacientes y su asociación con resistencia a diferentes drogas puede dar las claves para mejorar el tratamiento del SIDA.

 

Era7 Bioinformatics también proporciona consultoría en el diseño experimental de estudios clínicos y en la extracción de resultados con significado clínico. En colaboración con el departamento de software podemos diseñar e implementar bases de datos específicamente orientadas a proyectos de genotipado que persiguen un tratamiento del SIDA más personalizado.