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mejora de ensamblajes

El programa newbler que se utiliza para ensamblaje de novo de secuencias obtenidas con el 454 analiza directamente los flowgrams. En muchos casos un análisis experto puede mejorar el ensamblaje utilizando otros algoritmos de ensamblaje y la información obtenida en la anotación funcional de secuencias.

 

Basándose en el análisis de la estructura de operones, en el análisis de motifs y de similitudes de BLAST de las secuencias parciales de los extremos de los contigs y usando herramientas de comparación de genomas podemos mejorar el ensamblaje final de un genoma.

 

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