algoritmos de análisis de secuencias

Actualmente nos encontramos trabajando en:

 

nuevo algoritmo de alineamiento múltiple
Nuestro equipo de investigación está involucrado en el diseño de un nuevo algoritmo de alineamiento múltiple de secuencias basado en una aproximación totalmente nueva que puede ser más adecuada para resolver algunos de los problemas que existen actualmente con la comparación de muchas secuencias a la vez. Las nuevas estrategias de análisis de genomas introducidas en los proyectos de metagenómica y las nuevas tecnologías de secuenciación NGS están haciendo surgir nuevos problemas de comparación de secuencias. Nuestro algoritmo responde a algunos de estos retos.
análisis de palindromía
Muchos motifs de secuencia funcionalmente relevantes son palindrómicos. El análisis de la palindromía en secuencias de ADN es aporta un nuevo dato útil en el descubrimiento de patrones de unión, especialmente en la detección de sitios de unión correspondientes a reguladores de la transcripción que tienen un patrón de unión palindrómico. Era7 Bioinformatics está desarrollando una nueva herramienta de análisis de palindromía a escala de genoma.
algoritmo para detectar mimetismo molecular
La disponibilidad de las nuevas tecnologías de computación de alto rendimiento en servidores virtuales (cloud computation) permite afrontar la búsqueda de motifs de aminoácidos compartidos comparando un gran número de secuencias. Los receptores virales están entre las secuencias diana que queremos explorar usando un nuevo algoritmo propio que hemos diseñado específicamente para esta tarea.