bases de datos de Investigación
El diseño de bases de datos para el manejo de datos biológicos y biomédicos es uno de nuestros intereses investigadores.
La base de datos ExtraTrain (www.era7.com/ExtraTrain), desarrollada por Era7 Bioinformatics Unit, es una base de datos de factores de transcripción y de secuencias intergénicas no codificantes bacterianas. Fue publicada en BMC Microbiology.
En Era7 Bioinformatics Utit estamos interesados en buscar nuevos paradigmas para integrar los diferentes elementos de conocimiento disponibles en torno a la unidad "proteína". En particular estamos desarrollando nuevas estrategias para presentar la información de la forma más comprensible posible al usuario
Además del diseño interno de la base de datos somos especialistas en el diseño de interfaces adaptadas a las capacidades de las personas para reconocer patrones o identificar relaciones entre elementos. La representación de redes basada en las relaciones almacenadas en las bases de datos y el desarrollo de herramientas para manejar estas redes son de especial interés para nosotros.
Estamos interesados en participar en proyectos de colaboración para desarrollar bases de datos de ADN o proteínas.
Publicaciones
ExtraTrain: a database of Extragenic regions and Transcriptional information in prokaryotic organisms.
Pareja E, Pareja-Tobes P, Manrique M, Pareja-Tobes E, Bonal J, Tobes R.
BMC Microbiol. 2006 Mar 15;6:29.